تأسست منظمة الإرشاد الإسلامية (جمعية الإصلاح والإرشاد الإسلامية) في 6 سبتمبر 1914 (15 شوال 1332 هـ). يشير هذا التاريخ إلى تأسيس أول مدرسة للإرشاد الإسلامية في جاكرتا. ولم يصدر اعترافها القانوني من حكومة المستعمرة الهولندية إلا في 11 أغسطس 1915.

الشخصية المحورية في تأسيس الإرشاد هو العلامة الشيخ أحمد السوركتي الأنصاري، عالم كبير من مكة أصله من السودان. بعد تأسيس المدرسة في جاكرتا، بدأ طلاب الشيخ أحمد السوركتي الأنصاري بتأسيس المدارس في مناطق مختلفة. ومن بينهم من أسس مدرسة الإرشاد الإسلامية بوروكيرتو الابتدائية حوالي عام 1932 م.

حصلت مدرسة الإرشاد الإسلامية بوروكيرتو في فترة ما بعد الاستقلال على ترخيص حكومي في عام 1947 كمدرسة ابتدائية. ثم في السنوات اللاحقة، بدأت تدريجياً في تأسيس وحدات مدرسية أخرى. حتى الآن، توجد عدة وحدات مدرسية، بدءًا من رياض الأطفال، والروضة، والمدرسة الابتدائية 01، والمدرسة الابتدائية 02، والمدرسة الإعدادية، وثانوية العلوم الإسلامية، والإعدادية الداخلية، والثانوية الداخلية، والجامعة الداخلية.